Если исходники лежат на Вашем сервере и доступны только Вам то не зачем волноваться. Но если Вы передаете исходники заказчику, а в нем содержится секретный код ядра вашей СуперCMS или подобное, то нужно
обфусцировать код (такое взломать можно, но сложно). Но на моей памяти есть только 1 случай защиты кода (случай кстати не особо удачный).
