Зачем удалять dev ветку из svn?

Гонит ваш PhpStorm. Во-первых, он не предлагает ничего удалять. Просто пишет, что после интеграции изменений в trunk нельзя будет просто так забирать изменения из trunk обратно в develop, и нельзя будет объединить изменения повторно.

Мне кажется, что оба ограничения, возможно, были актуальны для SVN 1.6 и ранее, а в SVN 1.8 и 1.9 всё должно быть работоспособно даже с перекрестными слияниями. Сколько читал официальную доку SVN, такого ограничения не видел.