Есть такая штука — AAM, погуглите по этому термину и найдете утилиты могущие менять уровень издаваемого шума, но сразу предупреждаю — в ущерб производительности. А еще посмотрите не вызывает ли шум, от которого вы хотите избавиться (т.к. обычные харды в работе редко слышно сами по себе) следствием вибрации, тогда вам поможет изолирующая прокладка между ним и корпусом.
