вопрос в сущности такой: есть сервер. на нём хостятся несколько сайтов со своими доменами. ip один на всех. необходимо сделать так, чтобы у каждого сайта была своя почта со своим pop3 и smtp. например сайт example.com, почта: pop3.example.com и smtp.example.com. и так у каждого сайта. в какую сторону копать?
Лучше запарковать все домены на domain.yandex.ru, а чтобы сайты работали создать A записи.
Потому как полноценную почту организовывать на своем серваке крайне муторно. Если и настроить, начнут вылезать проблемы с доставкой почты до адресатов из-за всяких фильтров от спама.