Есть ли утилита для Debian с функциональностью как у портов FreeBSD?

А пакеты в его библиотеке всегда устаревшие немного?

Смотря с какой ветки стягиваете обновления пакетов.

Сделал apt-get update. Потом apt-cache search и нашел уже довольно старую версию php - 5.4. Про ветки вы не могли бы пояснить?
В sources.list:
# wheezy
#
deb ftp.ru.debian.org/debian wheezy main contrib non-free
deb-src ftp.ru.debian.org/debian wheezy main contrib non-free

#
# Security updates
#
deb security.debian.org wheezy/updates main contrib non-free
deb-src security.debian.org wheezy/updates main contrib non-free