Хотел посмотреть какой у меня AllowOverride стоит в настройках, но файлов конфигурационных много, а grep что-то не работает (или я неправильно им пользуюсь).
В каком из файлов в Debian сейчас определяется AllowOverride?
Оптимус Пьян, а какой из них вы создавали? Вы точно уверены что она ставится в PHP а не в настройках самого апача?
я лично ставил общую настройку, для всех сайтов, конфиг - /etc/apache2/apache.conf