в php принято использовать PEAR стиль, нынче Zend Framework, это два самых мощных набора библиотек, которые можно легко интегрировать в свой проект. Будет очень неприятно, когда в проекте получится смешание стилей. лучше просто используйте его без раздумия, хотя есть масса плюсов и минусов.
Если хотите разобраться с вопросом подробнее, то советую почитать Макконнелла: Совершенный код
Это вом ещё раз докажет, что нет идеального подхода.
