Сначала ставите обычный дебиан, разбиваете диски и делаете необходимые рейды. Далее добавляете репозиторий проксмокс и устанавливаете его. Всё описано в родной вики проксмокса.
Пожалуй это будет самый подходящий вариант. Только у меня еще 1 вопрос, можно ли поставить проксмокс на диске допустим 80гб, а из 2 320гб сделать RAID1 и все отдать для хранилища виртуальных машин. Таки да вопрос немного глупый, я но все таик спрошу :)