Насчёт Kohana не скажу, но в php возможно использование Shared Memory Segments для этих целей.
См.
ru2.php.net/manual/en/book.shmop.php
Если ваше приложение не завершается по завершению обработки HTTP-запроса, вы наверное хотите запустить его в режиме демона?
