Похоже, проблема была в глючном msi-пакете вайбера. Дело в том, что он по умолчанию устанавливается в папку профиля пользователя, и чтобы направить его в Program Files мне пришлось использовать модификацию (transforms.mst), где я прописал нужный путь установки. И то ли из-за этого, то ли по другой причине, но установка вайбера зависала в самом конце процесса и вызывала выше описанные проблемы. Пришлось вручную выпиливать эту установку путём запуска произвольного msi-пакета и нажатием "да" в ответ на предложение откатить предыдущую установку.
Что касается 1C:Enterprise 8, то это был единичный случай: может интернет-соединение отвалилось, а может пользователь не дождавшись окончания установки вырубил ноутбук.
Мораль сей басни такова: не распространяй сомнительные msi-пакеты на предприятии (msi-пакет вайбера сомнительный не только из-за прикрученного transforms.mst, но ещё и потому, что ссылка на него нигде не опубликована - я её случайно "поймал", изменив расширение файла в обычной ссылке на exe-шник).