Решил у себя такую же проблему.
https://github.com/emmetio/livestyle-sublime/issues/49
Из-за ошибки(описки) в css файле в консоли SiblimeText3 (Ctrl+`) выводилась ошибка (Invalid CSS file) и LiveStyle не хотел парсить этот файл.
Причем где-то это кэшируется.
Помогло только, когда переместил содержимое файла в новый файл, который создал в PHPStorm. При этом исходный файл сохранил пустым. => Перезагрузил систему. => Залил содержимое файла обратно.
И все работает!!! )))
