Проблема заключалась в том, что через FTP слишком большая задержка и файл брался, но он был пустым.
Решение:
+ var sleep = require('sleep'),
gulp.task('js', function() {
sleep.msleep(1500);
return gulp.src([
'app/libs/jquery/dist/jquery.min.js',
'app/libs/jQuery.mmenu/dist/hammer/hammer.js',
'app/libs/jQuery.mmenu/dist/jquery.mmenu.all.js',
'app/libs/slick-1.8.0/slick/slick.min.js',
'app/js/common.js', // Always at the end
])
.pipe(concat('scripts.min.js'))
//.pipe(uglify()) // Mifify js (opt.)
.pipe(gulp.dest('app/js'));
//.pipe(browserSync.stream())
});