Использование OneDrive для бизнеса подразумевает, что копия данных сотрудника будет храниться в подписке Office 365, т.е. в онлайн хранилище Sharepoint Online. Таким образом, можно считать что часть задач резервирования решена "из коробки".
На стороне пользователя можно настроить "контроль версий". Если нужно организовать дополнительный бэкап со стороны облака - нужны коммерческие утилиты.