Условие такое: если со скрипом, но еще работает система.
1. Качаем лайв CD (Admin PE тема, там все есть)
2. Запускаемся с него, открываем консоль пишем chkdsk C: /f /r #(Раздел выбираете битый, в примере это С:)
3. Ждем очень долго
4. Потом Acronis Disk Director'ом клонируем полностью Диск, если Таблица разделов MBR.
4.1 Если GPT и UEFI- Копируем Тома по очереди
4.2 Нужно назначить букву тому с названием ESP (например D)
4.3 Открываем консоль и в ней пишем bcdboot C:\Windows /s D: /f UEFI (C:\Windows это пример, нужно выбрать том с уже скопированной системой на новом диске)
5. После как все сделали, вырубаем комп, отключаем старый диск.