Думаю лучше использовать 2x Intel Xeon E5620 — в бОльшее количество ядер ЦП проще распихать кучу тредов апача\нждинкса, которые возникают при интенсивной нагрузке. А использовать настольный FX-8350 вообще рисковое занятие — не думаю что с этим камнем Вы сможете задействовать ECC память — а без ECC ответственные вещи не делаются.