Нашел альтернативное решение проблемы, причём оно работает для Skype и подобных программ.
Заходим в Finder\Программы и вызываем контекстное меню на Skype:
Выбираем "Показать содержимое пакета" и находим внутри папку Contents\MacOS\
внутри которой находится исполняемый файл Skype для терминала, запускаем его.
По идее здесь система должна спросить нас хотим ли мы предоставить разрешение камеры для терминала.
Выдаём необходимые разрешения для камеры и микрофона, после этого всё будет работать.
Единственный минус данного метода - это что каждый раз придётся запускать нужную нам программу таким путём.
Может кто-то сможет что то придумать сделать это удобнее, тогда напишите здесь.