"FILTER_NAME" => "arrFilter",
UPD. НЕ заметил указанного этого параметра.
Проблема в том, что компонент catalog.section не принимает глобальный фильтр [И в коде не работает с ним]. Да, такая беда.
Варианта 2:
1. Использовать для вывода catalog.top (Который учитывает этот фильтр)
2. Допилить catalog.section. Перенести в свое пространство и на 466 строке
$arFilter = array(
"IBLOCK_ID"=>$arParams["IBLOCK_ID"],
"IBLOCK_ACTIVE"=>"Y",
"ACTIVE"=>"Y",
"GLOBAL_ACTIVE"=>"Y",
);
заменить на примерно
if(strlen($arParams["FILTER_NAME"])<=0 || !preg_match("/^[A-Za-z_][A-Za-z01-9_]*$/", $arParams["FILTER_NAME"]))
{
$arrFilter = array();
}
else
{
$arrFilter = $GLOBALS[$arParams["FILTER_NAME"]];
if(!is_array($arrFilter))
$arrFilter = array();
}
$arFilter = array_merge(array(
"IBLOCK_ID"=>$arParams["IBLOCK_ID"],
"IBLOCK_ACTIVE"=>"Y",
"ACTIVE"=>"Y",
"GLOBAL_ACTIVE"=>"Y",
),$arrFilter);
Конечно, при этом в $arParams в файле section.php в шаблоне компонента подать и имя фильтра, т.е.
"FILTER_NAME" => $arParams['FILTER_NAME'], 
