wkololo_4ever

Ваш экземпляр класса Customer не отслеживается EF`ом. Нужен весь код. Попробуйте использовать Attach()

Как количество записей в таблице может повлиять на сложность переноса на code first?
ps: Первый линк в google msdn.microsoft.com/en-us/data/jj200620.aspx (если я Вас правильно понял)

"Далее передаю пользователя в представление. И каждый раз как я в представлении обращаюсь к информации по филиалу или компании , например так:
@Model.Branch.Company.Name
происходит запрос к БД. "
var user = UserManage.Users.Include(b=>b.Branch.Company).FirstOrDefault(u=>u.Id == id).ToList();

В 95% случаев, когда вам нужна связь один ко одному, вы не правильно спроектировали бд.