В категориях выбери Товары и зайди в редактирование. Там войди во вкладку Данные и в Родительская категория удали все содержимое. И все что было в списке содержимых редактируй каждую категорию в данных поставив везде галочку в Главное меню. Так же что бы товары скрыть убери галочку Главное меню