Скобки проставь в операторах и убери функции!:
$(document).ready(function(){
$("#logoup").click(function(){
$('#logoup').toggleClass('move');}
});
if ( !$("#logoup").hasClass('move') ) {
$("#logo").animate({top:"-=200"}, "slow");
$(".menu-main").animate({top:"+=50"}, "slow");
$("#contact").show(1000);
}
} else {
$("#logo").animate({top:"+=200"}, "slow"
$(".menu-main").animate({top:"-=50"}, "slow");
$("#contact").hide(1000);
}
});
});
Анимации на jquery - это сложно и никому не нужно, проще делать это с помощью движков анимаций
gsap (GreenSock Animation Platform)
--или--
anime.js
Это движки для анимаций, но есть и вещи более проще, для соответственно более простых анимаций. Например: css @keyframes