Создайте контейнер, в нем ссылку на главную, после форму поиска а затем уже меню.
<div class="container">
<a href="/" class="home">Главная</a>
<div class="form-box">
<form role="search" method="get" class="flex" action="form.php" >
<input type="search" class="search_field_menu" placeholder="Поиск по сайту" required autocomplete="off" value="" />
<button type="submit" class="search_submit_menu" value="найти"></button>
</form>
</div>
<?php
wp_nav_menu( array(
'theme_location' => 'nav_top',
'container' => 'nav',
'menu_class' => '',
'items_wrap' => '<ul>%3$s</ul>'
));
?>
</div>
