Wataru

Можно просто удалять через delete после вызова, но это ужасный подход.

На самом деле, вам тут не нужна динамическая память. Сам класс Vector не жрет много памяти. Поэтому mulVec может возвращать просто Vector, а не указатель на него. Cам Matrix4x4 тоже не жрет память, поэтому не надо заводить и на него указатели. Вся память у него внутри в указателе data (кстати, вы же в деструкторе ~Matrix4x4 эту data удаляете же?).

Если же там еще что-то и Vector большой, то возвращайте unique_ptr или shared_ptr на него. Тогда все само удалится, когда надо.

И еще, в вашем текущем коде вы в main выделяете test, а потом перезаписываете. Тут у вас происходит утечка памяти. Его надо было delete-нуть перед перезаписью, это же указатель. Это хороший пример, почему вот так использовать сырые указатели где не надо - это плохо. Легко ошибиться: надо всегда помнить, кто ответственен за удалиение указателя.

Если это, таки, С++, то используйте std::vector. Одна функция его создает и возвращает, другая печатает.
Чтобы не было лишнего копирования передавайте как константную ссылку:

std::vector<int> MakeArray();
void Print(const std::vector<int> array);

Если надо работать с сишными массивами, то тогда придется длину возвращать отдельно через выходной параметр. Передавайте как указатель + длина.

int* MakeArray(int *len);
void Print(int *array, int len);

Вам нужна тупо функция, которая читает К строк и которая пропускает K строк.

Тогда ваш код становится в Skip(N-1), Read(M-N+1), Read(K-M+1) и читает файл ровно один раз.

Нет, надо просто прочитать n символов и поддерживать текущий символ, индекс начала группы и длину группы.
Когда прочитали символ, если он не равен предыдущему, то выводите группу. Если равен, то увеличивайте длину группы. После цикла не забудьте вывести последнюю группу. Еще, для удобство изначально надо инициализировать ваши переменный группой длины 1 с первого символа и начать итерироваться со второго.

Вы ваш исходник на C++ пытаетесь запуcтить. как будто это java.

Настройте eclipse для работы с c++. CDT вроде плагин назывался, который надо поставить.

Вы работаете с matrix, как если бы это был массив, но у вас это не массив. Или переопределите оператор [] или как-то выдавайте из matrix наружу T**.

Под винду собираете? exe-шник получается такой большой, потому что туда впендюривается почти весь libc.

Мелкий файл вы получите, если напишите на чистом winapi и скомпилируете msvc. Ну, или с динамической линковкой всех библиотек, но ваш exe без установленных в системе VС++ redistributables работать не будет.

Что у вас за операция пересечения?

Первая проблема - вы берете максимальную длину двух строк в size и потом проходитесь циклом до size по обеим строкам. Но ведь более короткой строки там просто нет - вы обращаетесь к не вашей памяти.

Вам надо проверять, есть ли обе строки по индексу i, прежде чем сравнивать их.

Вторая проблема - вы создаете result размером ровно на количество совпадений, а пишете туда в цикле до size. Т.е. если у вас вообще ни одного совпадения, то массив result будет пустым, но вы там можете хоть 10000-ый элемент записать, если строки достаточно длинные.