Wataru

Если это, таки, С++, то используйте std::vector. Одна функция его создает и возвращает, другая печатает.
Чтобы не было лишнего копирования передавайте как константную ссылку:

std::vector<int> MakeArray();
void Print(const std::vector<int> array);

Если надо работать с сишными массивами, то тогда придется длину возвращать отдельно через выходной параметр. Передавайте как указатель + длина.

int* MakeArray(int *len);
void Print(int *array, int len);

Вам нужна тупо функция, которая читает К строк и которая пропускает K строк.

Тогда ваш код становится в Skip(N-1), Read(M-N+1), Read(K-M+1) и читает файл ровно один раз.

Нет, надо просто прочитать n символов и поддерживать текущий символ, индекс начала группы и длину группы.
Когда прочитали символ, если он не равен предыдущему, то выводите группу. Если равен, то увеличивайте длину группы. После цикла не забудьте вывести последнюю группу. Еще, для удобство изначально надо инициализировать ваши переменный группой длины 1 с первого символа и начать итерироваться со второго.

Вы ваш исходник на C++ пытаетесь запуcтить. как будто это java.

Настройте eclipse для работы с c++. CDT вроде плагин назывался, который надо поставить.

Вы работаете с matrix, как если бы это был массив, но у вас это не массив. Или переопределите оператор [] или как-то выдавайте из matrix наружу T**.

Под винду собираете? exe-шник получается такой большой, потому что туда впендюривается почти весь libc.

Мелкий файл вы получите, если напишите на чистом winapi и скомпилируете msvc. Ну, или с динамической линковкой всех библиотек, но ваш exe без установленных в системе VС++ redistributables работать не будет.

Что у вас за операция пересечения?

Первая проблема - вы берете максимальную длину двух строк в size и потом проходитесь циклом до size по обеим строкам. Но ведь более короткой строки там просто нет - вы обращаетесь к не вашей памяти.

Вам надо проверять, есть ли обе строки по индексу i, прежде чем сравнивать их.

Вторая проблема - вы создаете result размером ровно на количество совпадений, а пишете туда в цикле до size. Т.е. если у вас вообще ни одного совпадения, то массив result будет пустым, но вы там можете хоть 10000-ый элемент записать, если строки достаточно длинные.

Не совсем понятен вопрос, но есть комментарии по стилю в method1. Лучше передавать указатель вместо неконстантной ссылки. Так из места вызова сразу видно, что передаваемое значение может меняться. На некоторых проектах это прописанно в правилах.

Если вы про имя параметра, то обычно члены класса делают приватными и это как-то отражается в имени. Например, в конце имени ставится _. А у аргумена функции - нет. Вот они и будут различными. Если же вам нужен именно публичный член класса, то не проблема, что они совпадают, ибо из метода можно обратиться к члену через this и параметру просто так. Но это опасно - можно где-то перепутать и лучше все-таки чтобы имена параметров методов и членов класса не совпадали.

Да у вас непонимание базового синтаксиса. Нельзя делать свитч по нескольким переменным сразу. Там у вас запятая - это оператор, котоый возвращает последний элемент. Также в ифах.

Раз вам число нужно десятичное, то и задавайте его в десетичной системе, без ведущих нулей.

Чтобы дополнить число нулями до заданной ширины при выводе воспользуйтесь setw и setfill:

std::cout << std::setfill('0') << std::setw(4) << i1 << endl;

Посимвольный вводе через getch.