Если работать с AVR и что-то достаточно простое - это Proteus ISIS.
Если Вам предстоит решать более сложные задачи - это OrCAD. В нём вы найдёте такие режимы симуляции как аналоговый, дискретный и симбиоз двух первых.
Также хочу посоветовать NI Multisim - для меня он оказался интуитивно понятным, правда после изучения OrCAD.
