С одной стороны, прямое управление агрегатами кондиционера в обход его штатной электроники даёт вам максимальную степень свободы. В таком случае можно будет управлять кондиционером по любому доступному каналу связи и протоколу. Но, этот подход накладывает на вас и необходимость разработки, скажем так, обратной связи. Контроль напряжения и тока, частоты вращения, углов поворота шторок, значений температуры и влажности в доме и снаружи. Возможно, уровень каких-то технических жидкостей или давления в магистралях. Всё зависит от возможностей конкретного кондиционера. И от модели управления. Вам предстоит проделать (и повторить) путь команды специалистов, занимавшихся разработкой этого устройства. Всё это ложится на ваши плечи.
А с другой, у вас уже есть кондиционер, электроника которого занимается всеми описанными выше вопросами. И есть пульт от этого кондиционера. А ещё есть техническая возможность записать все те команды, которые поступают от пульта к кондиционеру. Вы можете неким устройством подменить сам пульт - отправлять команды вместо него. Вы можете установить свою плату внутри выносного блока и своим ИК светодиодом светить прямо в принимающий светодиод. А ещё можно подпаяться куда-нибудь к ножкам.
Второй вариант мне больше нравится в плане гибкости.
