"... много лишнего, непонятного..." - вот ключевая фраза. Похоже, человек просто не понимает, что такое бутстрап и с чем его едят. Тогда стоило бы ему немного подтянуть свои знания.
С другой стороны, если изначально дизайн-макет нарисован не под сетку, а вы верстаете его в жесткой сетке, то почти наверняка вы ломаете задуманный дизайнером макет. Насколько в вашем производственном процессе это допустимо - это вам видней. Так что и доля справедливости в негодовании веб-мастера, возможно, тоже есть