Больно глазам смотреть на консольную выдачу...
Это весь код?
А что и как читает функуция read.dta?
Там еще пара пользовательских функций проглядывает, для которых в вашей консольной выдаче не видно определений.
Т.е. до начала, приведенного Вами текста там уже что-то происходило.
Например, какой-то код уже загружался или вводился вручную.
Положите R код по максимуму (или распечатку от начала сессии в R) и, желательно файл данных.
Попробую помочь.