vitland

Спасибо за советы!
Я пока нуб и без понятия, что такое профайлинг, как логгировать запросы и их интерпритировать. И на данном этапе в таком сложно разобраться.
Пока же решил проблему изменив запрос к базе, убрал сравнение массивов. Производительность значительно подросла.

function sendFilesByQuery(chatId, query) {
  User.findOne({ telegramId: chatId }).then((user) => {
    // фильтры на основе которых формируется запрос
    if (user.filter.time === 1) {
      time = { $gte: 2000 };
    }
    if (user.filter.time === 2) {
      time = { $gte: 2015 };
    }
    if (user.filter.pop === 1) {
      pop = { $lt: 71 };
    }
    if (user.filter.pop === 2) {
      pop = { $gt: 9 };
    }

    if (user.filter.time === 0) {
      delete query.year;
    }
    if (user.filter1.pop === 0) {
      delete query.viewed;
    }

    query = {
      type: query.type.toString(),
      viewed: pop,
      year: time,
//Здесь отсеиваются просмотренные файлы
      _id: {
        $nin: watched, 
      },
    };

    File.find(query).then((file) => {
      rndfile = file[Math.floor(Math.random() * file.length)];
      let allfiles;
      let userfiles;
      switch (query.type) {
        case "1":
          userfiles = user.files1;
          allfiles = user.allfiles;
          break;
      }

      bot.sendDocument(chatId, rndfile.gif);
      if (!rndfile) {
        bot.sendMessage(chatId, "text");
      }
      if (userfiles1.length >= allfiles.length - 1) {
        clearfilesType(user.telegramId, query);
      }
    });
  });
}

Проблемы была в ночном режиме, жирный и обычный текст почти не отличаются))