Используйте localStorage для хранения данных авторизации(лучше хранить токен авторизации).
При открытии приложения проверяете данные в localStorage, если есть данные и они валидны, то запускаете проверку Touch Id, если нет перебрасываете на страницу авторизации.
Плагин Touch Id
https://github.com/EddyVerbruggen/cordova-plugin-t...