Как оказалось, дело было не в дуплексах, а просто в дешевых китайских сетевых картах. Т.е. и встроенная в гигабайтовскую материнку и PCI сетевая tp-link давали более 50% потерянных пакетов на передаче. При этом в двух ноутах встроенные сетевухи работали на том же линке прекрасно (длинна всего 80 метров!). Сейчас временно решил проблему просто подключив комп через свич Dlink, позже — просто куплю нормальную сетевую карту.