Вы усложняете себе жизнь, dovecot здесь не нужен, если вы не создаете полноценный почтовый сервер (это к слову о том, что тег dovecot здесь явно лишний).
Чтобы складывать в базу полученные сообщения достаточно подключить к postfix транспорт в виде бекенда на любом php, который будет парсить входящие письма и складывать их в базу в нужном формате.
Гуглите на тему "postfix transport pipe".