Я с другой стороны это решил:
В /etc/apache2/sites-available/otrs.conf добавил:
RedirectMatch ^/$ "/otrs/costumer.pl"
RedirectMatch ^/admin/$ "/otrs/index.pl"
1) Прописать в /etc/fstab нужную точку монтирования второго диска.
2) а) создать симлинки на нужные каталоги $ ln -s /media/3tb-vol1/Music/music Музыка
б) в /etc/fstab добавить правила монтирования папок в соответствующие места.