Как создать символическую ссылку на файл в /bin/, дабы запускать строкой без ./?

Герман, В /etc/profile добавить/изменить строку
PATH=$PATH:/путь/до/папки
Если требуется только для определённого юзера, то то же самое, но в ~/.profile

Как узнать логин единственного юзера в виртуальном образе Ubuntu Server?

С любого livecd примонтируй корневую фс свежеустановленной системы и смотри /etc/passwd и /etc/shadow

Как прокинуть порт?

Exodus11, /ip firewall filter add chain=input protocol=tcp dst-port=3998 in-interface=ether1 action=accept
/ip firewall filter add chain=forward protocol=tcp dst-port=3998 in-interface=ether1 action=accept

Мог опечататься немного, т.к. пишу с телефона, но смысл думаю от этого не пострадает.

Можно ещё закрывающие правило drop подправить как в официальном стандартном конфиге:
/ip firewall filter
add action=drop chain=forward \
comment="defconf: drop all from WAN not DSTNATed" connection-nat-state=!dstnat \
connection-state=new in-interface-list=WAN