ubuntor

Попробуйте telnetom проверить доступность 20, 21 портов для ftp.
У меня ещё был такой нюанс, что по домену winscp пытался на ipv6 коннектится, решилось сменой домена на ipv4 сервера.

Решилось отключение кэширования на сервере, точнее его перенастройкой (не вдавался в подробности)