Решено: Затупил, у меня не та тема была подключена, в вп который codeigniter юзает.
Нужно было просто перезалить тему с файлом functions.php и типы записей подтянулись сами собой.
вроде разобрался.
Нужно скачать Wordpress положить его в папочку рядом с СI и юзать сколько душе угодно )
Правда некоторые функции ядра WP всё же придется переписать :(
