Можно создать бат-файл, который считывает содержимое файла file.txt, затем разбивает его по пробелам и для каждого элемента создает папку с соответствующим именем и файл внутри этой папки с таким же именем.
@echo off
setlocal enabledelayedexpansion
REM Читаем каждую строку из файла file.txt
for /f "tokens=*" %%i in (file.txt) do (
REM Разбиваем строку на отдельные элементы
for %%j in (%%i) do (
REM Создаем папку с соответствующим именем
mkdir %%j 2>nul
REM Создаем файл в этой папке с тем же именем
<nul (set /p=%%j) > %%j\%%j.txt
)
)
echo Done.
pause