Решилась задача таким образом: вместо определения datepickera для всего div, я его определил для 2х разных
$('#dateOfBirthFrom').datepicker({
autoclose: true,
defaultDate: "",
format: 'dd-mm-yyyy',
startDate: new Date('01-01-1900'),
endDate: new Date(),
}, function (start) {
from = $('#dateOfBirthFrom').val(start.format('DD-MM-YYYY'));
});
$('#dateOfBirthTo').datepicker({
autoclose: true,
defaultDate: "",
format: 'dd-mm-yyyy',
startDate: new Date($("#dateOfBirthFrom").datepicker("getDate")),
endDate: new Date(),
}, function (end) {
to = $('#dateOfBirthTo').val(end.format('DD-MM-YYYY'));
});