Денис Каримов

Ну, сам спросил, сам и отвечу. PHP блокируется в конфигах.
Файл /etc/apache2/mods-available/php5.conf. Необходимо закомментировать строки:

<IfModule mod_userdir.c>
    <Directory /home/*/public_html>
        php_admin_flag engine Off
    </Directory>
</IfModule>

То есть:

# <IfModule mod_userdir.c>
#     <Directory /home/*/public_html>
#         php_admin_flag engine Off
#     </Directory>
# </IfModule>