1. Никуда не переносить, иначе вы допереноситесь до ситуации, когда ваш SSD будет отключенным лежать на полке в сейфе. Ну и что, что бесполезен, зато не сломается гарантировано.
2. В правильно постронной системе, к которой относится Windows 7 без твиков и без отключения UAC, в Program Files при работе не пишут. Следовательно использование доступа к файлам в Program Files это оптимальное использование SSD, и ресурс его не снижает даже теоретически.