toxa82

Ну примерно так:

while (true) {
    $sql = 'UPDATE `score` AS s, `auto1` AS a
        SET s.score = s.score + (a.`card` * 3.75 + a.`cardrack` * 7.5 + a.`videocardroom` * 15)
        WHERE s.vk_id = a.vk_id'
    $db->query($sql);
    // sleep(1); // Подозреваю что апдейт будет выполнятся больше секунды
}

DISTINCT распространяется на все столбцы указанные в SELECT, а у тебя id не повторяется. Используй GROUP BY по нужным тебе столбцам.

Это будет обычный INSERT только вы сами должны в данных подставить нужный user_id. Проверка целостности данных можно сделать с помощью внешних ключей таблицы, тогда БД не даст создать запись с несуществующим user_id в таблице user

Например у нас миллионы строк в таблице которым нужно изменить флаг, чтоб не делать это одним запросом который заблокирует всю таблицу, делается бесконечный цикл с условием что изменены > 0 строк и с помощью лимита ограничивается кол-во строк для апдэйта. Так флаг меняется небольшими пачками (100, 500, 1000 строк), которые выполняются быстрее и не блокируют всю таблицу, что позволяет избежать deadlock'и.

Похоже что, сервер перестал видеть ";" как разделитель запросов. Может у вас где-то в коде используется DELIMITER и забыли вернуть обратно ";"?
Также можно переписать в один запрос:

INSERT IGNORE INTO `tags_list` (`word`) VALUES ('рыба'), ('мясо'), ('птица');