Название таблицы: settings
В таблице 4 столбца: name, data, updated_at, updatet_to
Данные в столбце data храним в формате JSON или serialize.
В data храним соответственно все настройки.
В updated_at храним дату и время изменения настроек.
В updatet_to храним ID пользователя который изменил настройки.