Добрый день.
Запускай через логон скрипт для компьютера (Comp conf - Policies - Win Sett - Scripts - startup) - тогда будет идти установка от имени системной учетки. Один нюанс - в перимшинах на папку с установщиком и батником должны быть включены Domain Computers на чтение, иначе доступа не будет к установщику машинке)