Иван Томилов

В дополнение к ответу Александра, если требуется не только прочитать какие-то данные из сторонней программы, но еще и что-то ввести в ее стандартный поток ввода (как я понял, основная задача именно в этом), можно поступить так:

package main

import (
	"fmt"
	"log"
	"os/exec"
)

func main() {
	cmd := exec.Command("cmd", "/C", "C:/gopath/src/script/for.exe")

	// Чтобы вводить что-то в стандартный поток ввода другой программы, нужно получить ее pipe.
	pipe, err := cmd.StdinPipe()
	if err != nil {
		log.Fatal(err)
	}
	// Куда впоследствии можно что-то писать.
	pipe.Write([]byte("piggybank"))
	// После ввода всех данных нужно обязательно его закрыть.
	pipe.Close()

	// Самый простой способ получить вывод другой программы, использовать:
	output, err := cmd.Output()
	if err != nil {
		log.Fatal(err)
	}
	fmt.Print(string(output))
}

Позволяет по дефолту, но не по тысяче строк, а в виде курсора, который двигается при каждом вызове rows.Next(), о чем подробнее можно прочитать в документации database/sql:
https://golang.org/pkg/database/sql/#Rows

Там же есть пример, который это иллюстрирует:

rows, err := db.Query("SELECT ...")
...
defer rows.Close()
for rows.Next() {
    var id int
    var name string
    err = rows.Scan(&id, &name)
    ...
}
err = rows.Err() // get any error encountered during iteration
...

Только в Go для конкретных баз данных написаны разные драйверы: https://github.com/golang/go/wiki/SQLDrivers
И хорошо бы заранее проверить в исходниках, что драйвер, который вы используете, действительно использует курсор внутри, а не считывает, например, сразу все в слайс и выдает элементы из него по одному.