Богдан Абрамов

Реализация: Создаем сессию ТАЙМЕР и приравниваем 0.
При действующем окне браузера, каждую секунду делаем запрос на обработчик и добавляем +1 сек к сессии ТАЙМЕР.

$(window).focus(function() {  AJAX запрос через  setInterval });

Сам обработчик:

if( isset( $_SESSION['timer'] ) AND $_SESSION['timer'] >= $timeout )
    {
    	$_SESSION['timer'] = 0;

    	echo 'Good Work!';
    } else {
    	$_SESSION['timer'] = $_SESSION['timer'] + 1;
    }

Может кому-то пригодится :) Всем спасибо за помощь!