Папку "node_modules" обычно удаляю используя
rimraf:
1.Ставлю пакет глобально через npm.
npm install rimraf -g
2. Захожу в консоли в нужную директорию.
3. Ввожу "rimraf name_of_folder"(например "rimraf node_modules").
Выше описанный способ подходит, если нужно удалить все подчистую... Если же нужно удалить конкретный пакет NPM, то через нативный
uninstall.
Как еще вариант: подредактировать package.json и сделать "npm install". NPM сейчас подчищает за собой- отсутствующее в файле пакеты удалятся.
