Нет, к сожалению не получится использовать эти метки, так как по сети вне хоста эти метки не передаются. Ими воспользоваться можно только в iptables на хосте. Поэтому, дропнуть их можно только там.
<VirtualHost *:80>
ServerName site
...
<Directory /home/www/site/www>
Options Indexes FollowSymLinks MultiViews
AllowOverride None
Order allow,deny
allow from all
Require all granted
</Directory>
...
</VirtualHost>