Столкнулся с подобной проблемой, разрабатывал свою тему.
Суть в том, что у меня используется js 3.2.1, а WP грузит свою библиотеку 1.12.4.
Я пробовал отключить полностью js WP и подключить свою библиотеку - не сработало :(.
НО есть решение именно ЗАМЕНИТЬ библиотеку на свою, пишем эти строчки в functions.php:
//Применяем свой jQuery
function modify_jquery() {
if (!is_admin()) {
wp_deregister_script('jquery');
wp_register_script('jquery', get_template_directory_uri() . '/js/vendor.js', false, '3.2.1', true);
wp_enqueue_script('jquery');
}
}
add_action('init', 'modify_jquery');

Я еще отправил все это дело в футер. CF7 v.4.9.2 - полет нормальный и на сайте используется js v.3.2.1