Если укажите более точную информацию, то вероятность получения ответа увеличится. Версия скайпа, версия федоры (архитектура), используется ли вебкамера. Возможно, в логах скайпах будет что-нибудь интересное. Воспроизводится ли проблема на новой установке или live cd.
Странно, что заработало. x1200 — старая видяха, её поддержку в проприетарных драйверах давно уже забросили. Если не сложно, покажите теперешний лог xorg`а. Интересно, а то у меня тоже есть похожая.
Я не сильно в теме, но вообще можно обратить внимание на логи того же microsoft update, посмотреть на проблемы в этой штуке, где собираются сообщения об ошибках от служб.
Ещё можно на вирусы и проблемы всякими cureit и avz проверить.