Проблема тут не в конфиге самого Dante, а в скрипте (точнее, systemd-юните) его запуска. Столкнулся с аналогичной проблемой; есть вероятность, что она вызвана примерно тем же, чем крайне похожая ситуация с nginx - systemd пытается найти pid-файл Dante до того, как тот успевает его создать. Лечение (во всяком случае, мне оно помогло) - не привязывать pid-файл к сервису, а при остановки сервиса удалять этот файл "руками". На практике нужно сделать следующее: в файле /lib/systemd/system/danted.service удалить строку
PIDFile=/var/run/danted.pid
И добавить (в раздел Service) строку
ExecStopPost=/bin/rm -f /var/run/danted.pid
