Ещё вариант — крышка отслоилась от кристалла внутри. В новых процессорах крышку, насколько читал, делают несъёмной, а раньше можно было снять и заменить подсохшую термопасту (сейчас — клей, приводящий к порче кристалла при попытке съёма). Но, так как далее всё в порядке, то это, скорее всего, несовместимость биоса с новым степпингом, например, исправляемый перепрошивкой.
(вентилятор на кулере вообще первые 20-50 секунд не влияет, инертность высокая. Вой в момент включения может быть как по скачку показаний биоса, так и в результате неустановки биосом начальных значений для ШИМ-вентилятора, а после инициализации частота входит в норму)
