...при условии, что футер должен быть частью основного блока, который располагается по центру страницы и сверху/снизу от него должны быть отступы.
Основное правило гласит, что все старшие и соседние элементы страницы должны быть с процентными стилями. Если, конечно, хотите сделать это на CSS без JS. Например, даже футер Хабра прилепляется к низу, если скриптами и юзерстилями записать резметке страницы такие правила. Бывает такая раскладка, что процентные стили расставить будет невозможно.
В Вашем случае - то, что по центру (по горизонтали) - несущественно. А вот Хедер и футер у вас должны быть сделаны 0% высоты, а остальными стилями вставить в них нужную ненулевую высоту блоков. Пример того, как это делается со страницами Хабра, описан здесь: http://habrahabr.ru/post/151320/ чтобы увидеть, как работает - поставить скрипт (лучше на Firefox или старую Оперу, там надёжнее работало) и перейти на короткую страницу, например, эту https://auth.habrahabr.ru/settings/privacy/ (до вчера работали QA, где было много коротких страниц). Так же будут работать и короткие статьи и прочее, например, страница подготовки статьи.